不过，从目前来看，补贴拖欠问题仍然不同程度存在，并未彻底解决。
国家能源局发布的一份名为《可再生能源发电项目审批简政放权落实情况驻点江苏监管报告》表示，可再生能源电价附加补助资金既存在着资格与认定程序周期较长问题，也存在着可再生能源电价附加补助资金拨付较为滞后问题。
上述报告表示，目前财政部门虽已较往年缩短了资金拨付时间，但实际尚未做到按季预拨，结算周期一般滞后3~5月，电网企业每月只能暂按火电的上网标杆电价与光伏发电企业结算，造成企业资金周转困难。
而这背后，涉及到的最本质的问题，则是价格补贴资金的来源问题。
从过去的情况来看，之所以出现普遍长达一年多的拖欠，其中既有发放程序需要理顺的问题，更不容忽视的是资金缺口问题。
数据显示，至2011年底，资金缺口达110亿元，并且补贴支付滞后。而2012年的情况则进一步严重，有未经官方证实的统计称，2012年可再生能源发展基金的资金缺口已达200亿元，其中光伏发电的补贴缺口约为五、六十亿。
不过，申银万国发布的一份报告则对此表示了乐观的看法。该报告称，由于风电电价可能下调，以及光伏发电转向补贴需求较小的分布式光伏项目，政府对于可再生能源发电补贴的实际支付，未来几年可能低于预期。而更加严格可再生能源补贴收支(得益于新的预算法的公布)以及现行合理的资金收集机制，补贴资金将能极大程度满足政府的支付需求。
上述报告预计，到2020年，风电补贴资金需求为493亿元，太阳能光伏发电补贴资金需求为430亿元，加上其他可再生能源补贴资金约在139亿元，整体补贴金额可达到1062亿元。
而在征收方面，预计到2020年，自终端用户征收的可再生能源电价附加可达857亿元，将超过市场的预期，并缓和政府在支付可再生能源发电补贴方面的压力。
