推动体制机制改革
针对水电行业现存问题、发展新形势及“十三五”水电规划布局，《征求意见稿》制定了水电工程前期工作、水电基地建设、中小流域开发、抽水蓄能建设、流域综合管理、科技装备开发、体制机制改革、水电开发扶贫、水电国际合作等9项重点任务。
其中，在体制机制改革方面，《征求意见稿》明确，要完善水电管理体制机制。根据国务院简政放权要求和电力体制改革精神，推进水电建设市场化，落实项目法人的市场主体地位，完善项目法人负责任制的水电建设管理体制。转变政府职能，强化行业服务和政府监管。总结金沙江水电开发协调工作经验，研究建立西藏水电开发协调机制，促进藏东南水电基地开发。研究流域梯级水电站水库综合管理体制，提出已建跨界水电站水库综合管理体制方案。
同时，将健全水电发展政策体系。开展龙头水库综合效益共享政策、建立西藏水电开发基金、水电发展促进地方经济社会发展、水电扶贫、界河水电开发利益协调政策措施等方面研究工作，完善相关政策措施。深化抽水蓄能电站作用、效益形成机制研究，加快推进水电电价市场化改革，逐步完善电价形成机制，促进水电可持续健康发展。
另外，根据《征求意见稿》，“十三五”期间，我国还将建立梯级运行协调机制。统筹流域综合监测和梯级联合优化调度运行，在大渡河、金沙江等流域逐步建立流域开发运行管理协调机制。探索各大流域按照现代企业制度组建统一规范的流域公司，逐步推动建立流域统一电价模式和运营管理机制。加强对已建抽水蓄能电站运行情况和利用状况的分析总结，学习和借鉴国外运行经验，结合电力系统实际，认真研究抽水蓄能电站在电力系统中承担的各项任务，以及与新能源电站联合优化运行方案，确保抽水蓄能电站充分发挥功能效用、提高利用效率。
重视水电开发扶贫
在水电开发扶贫方面，《征求意见稿》明确，将优先安排贫困地区水电项目建设。贯彻落实中央关于发展生产脱贫一批的精神，积极发挥当地资源优势，充分尊重地方和移民意愿，科学谋划、加快推进贫困地区水电重大项目建设，同等条件下优先布局和核准建设贫困地区水电项目，更好地将资源优势转变为经济和扶贫优势。
同时，调整完善资源开发收益分配政策。在加大贫困地区水电开发力度的同时，研究建立针对贫困地区能源资源开发收益分配政策，将从发电中提取的资金优先用于水库移民和库区后续发展，增加贫困地区年度发电指标，提高贫困地区水电工程留成电量比例，研究完善水电开发财政税收政策，让当地和群众从能源资源开发中更多地收益。
另外，《征求意见稿》显示，“十三五”期间，我国还将探索建立水电开发利益共享机制。探索资产收益扶贫，在不改变用途的情况下，财政专项扶贫资金和其他涉农资金投入水电项目形成的资产，具备条件的可折股量化给贫困村和贫困户，尤其是丧失劳动能力的贫困户，对在贫困地区开发水电占用集体土地的，试行给原住居民集体股权方式进行补偿，探索对贫困人口实行资产收益扶持制度，建立水电开发群众共享利益机制，让贫困人口分享资源开发收益。
