绿色证书交易是发挥市场机制促进可再生能源融入电力市场的重要手段
在目标引导制度和发电配额考核制度中，建立绿色证书交易机制是符合市场化改革方向的一个亮点和核心。
如果没有绿色证书交易机制，无论对电网企业提出消纳可再生能源电量比例要求，还是对发电企业提出可再生能源发电量占比要求，都会不可避免带上行政计划色彩，与市场化改革方向相悖。根据《通知》规定，燃煤发电企业可通过自建非水可再生能源项目或购买可再生能源绿色证书的方式，完成发电配额考核指标要求，即通过绿色证书交易机制，以市场化方式推进可再生能源发电配额机制的实施和促进可再生能源逐步融入电力市场。绿色证书交易机制与可再生能源电价和补贴政策之间有直接关联，应与电价和补贴机制改革相辅相成，协同推进。
考虑到电力体制改革提出要放开输配外的竞争性环节电价，发用电计划也将有序放开，新增的火电原则上都要参与市场，这样未来燃煤发电标杆电价存在的意义就会逐渐失去，这也意味着依托燃煤标杆电价的可再生能源价格及补贴机制要做重大调整。未来风电、光伏等可再生能源电价形成机制可能需要由分资源区标杆电价逐步调整为电力市场中的批发电价加上定额电价补贴两部分组成，即由现有的差价补贴向定额补贴转变。
因此，实施绿色证书交易机制，可再生能源发电的收益就将来自于电力市场上网价格、定额补贴和绿色证书收益三个方面，将会降低对政府财政补贴的需求；并且随着可再生能源成本下降、绿色证书机制完善，逐步提升绿色证书价格和收益，可加快可再生能源发电差价或定额补贴降低的步伐，尽快实现平价上网，使可再生能源发电完全参与电力市场。
从破解当前和近期可再生能源电价补贴资金难题角度，实施绿色证书交易机制可发挥重要作用。
到2015年底我国可再生能源电价补贴累计资金缺口约400亿元，补贴资金拖欠问题已对可再生能源发电全产业链造成影响，如果政策不做调整，“十三五”期间补贴缺口仍将存在并将逐年扩大。据初步测算，如考虑绿色证书交易实施起步阶段的几年内，一个绿色证书（一兆瓦时）价格约100元，则现有可再生能源基金规模基本可满足电价补贴需要。
发电配额和绿色证书机制重在有效落实
燃煤企业非水可再生能源发电配额考核和绿色证书交易机制的效力关键在于切实落实。关键点主要在几个方面：
一是明确年度考核指标，应根据可再生能源发展情况和规划目标，进行发电配额的年度指标分解，确定合适的年度电量比重指标，并将通过市场交易形成的绿色证书价格水平作为重要参照因素，调整年度指标，以及可再生能源发电差价或定额补贴水平。
二是尽快建立绿色证书管理和交易平台，分步骤启动交易。
三是加强对燃煤企业完成非水可再生能源发电配额情况的监测和考核，《通知》文件中已提出了明确的督促和严格的惩罚措施，切实落实将对可再生能源的持续健康发展起到重要的保障作用。
