尽管上网电价补贴政策促进了日本可再生能源发展，但目前该政策已被修改，未来也将持续面临各种挑战。据了解，日本政府认为最初的补贴政策对光伏产业的发展过于宽松和慷慨，应该逐年递减补贴额度。2012年，商业光伏发电每发一度电获得43.2日元补贴，而到今年，补贴只有25.92日元了。此外，日本政府还决定，允许公共事业单位减少采用不赢利的、可再生能源发送的电力。就在前不久，日本政府决定，将颁布一套新政策规划可再生能源发展。
结合以上情况，过去日本制定的对于光伏产业的激励政策和促进办法都几乎被归零。有专家预测，这种疲软的补贴政策将不利于日本光伏发展投资。而与此同时，其他赋予高期待的可再生能源，例如地热、小型水电、风电等技术，在日本的发展情况也仍不乐观，但他们的补贴政策相比光伏要好些。
神秘的“基本负荷电源”
2014年，日本内阁政府审核通过一项新修订的《能源基本计划》。该计划再次对核电和燃煤发电在日本能源结构中的作用进行评估和定位，认为两者都是“重要的基本负荷电源”，并且认为可再生能源将在一个很长的时间范围内逐步地取代其他能源。这个计划同时也在日本公布的《能源长期供应与需求展望2015》报告中体现。报告中，日本政府计划，到2030年增加电力需求（与2013年相比），并且公布了一组到2030年的发电占比组成比例：液体天然气占27%、煤炭占26%、石油占23%、核电占21%，其他可再生能源占3%。
从日本公布的计划可以看出，到2030年，日本对化石燃料的依赖还是非常严重的，几乎与福岛核事故发生前10年的平均水平一致。核电发电占比从27%降低到21%，其中的电力缺失几乎都是由增加的可再生能源发电补偿。
然而，剩下的20%~22%核电仍然可能存在一些问题。日本装机总量35吉瓦的核电站，利用率达到70%时就可以满足制定的目标。与此同时，按照核电站使用寿命和维修时间的40年年限，如果想要满足到2030年的能源结构目标，目前装机容量已经达到40吉瓦的核电站届时需要将容量减少到低于20吉瓦。即使是不再新建核电站或者延长电站寿命，也无法满足日本政府制定的目标。此外，日本公众强烈反对重启核电站也对未来实现目标造成巨大困难。
与此相似，扩大燃煤发电规模也面临着诸多挑战。日本是极少数同意增加燃煤发电的发达国家之一。全日本目前有47座燃煤电厂（总装机容量为22.5吉瓦）在建，多数是福岛核事故后计划新建的。专家介绍，如果这47座燃煤电厂全部完工，很容易就能够填补减少的核电发电量，并足以阻挠潜在的可再生能源发展。日本政府忽略该燃料将会产生的一系列相关影响，全力支持新建燃煤电厂，并认为这是一种“稳定、可靠”的基本负荷电源。
